突变率如何计算(2)

发布时间： 2018-07-11

　　那么Sanjuán如何能找到某个特点的时间点上的速率？他的诀窍在于只寻找致命的突变。这些在病毒颗粒中发现的HIV基因组的错误拷贝，它们存在于血细胞中，但不能感染其它细胞或进一步复制，它们是进化的“死胡同”。这意味着任何致命突变都必须发生在死亡病毒之前的那一代。

　　Sanjuán及其同事认为任何可能插入过早终止密码子的无义突变都可能是致命事件。基于HIV序列，研究人员认为这可能发生在基因组中的732,350个点上。

　　通过他们的样本分析，他们观察到3,069个可能致命的突变。然后就简单了：3,069个实际致死突变除以732,350个可能的致死突变，得到每个细胞感染周期的每个碱基突变率为4.1×10-3个突变。（PLOS Biol，13：e1002251,2015）

　　据推测，非致死突变也以相似的速率发生。这相当于每次复制病毒基因组时，每250个碱基就会出现一个突变，远远大于体外速率，这是目前已知生物学中最高的。